Действие разворачивается в колониальной Америке XVIII века, в годы Войны за независимость. Игрок поочерёдно управляет двумя героями: британским тамплиером Хейтемом Кенуэем и его сыном Коннором, полумохавком, вставшим на путь ассасина. Среди нововведений — морские сражения, охота, хозяйство на собственной ферме и смена сезонов, влияющая на геймплей.