Сэм Фишер внедряется в жестокую террористическую группировку, и впервые в серии ему приходится вести двойную игру: выполнять задания и спецслужбы, и террористов. Выбор между целями сторон влияет на сюжет и приводит к разным финалам, а от того, насколько аккуратно агент балансирует, зависит, сохранит ли он прикрытие.