Арены в этой части серии разделены на несколько уровней, так что бой может продолжиться на ярусе ниже. Здесь же появились кнопка бега, ускоряющая схватки, и Dial-A-Combo — удары, набираемые в связку как код. Перед матчем оба игрока могут ввести Vs.-код и открыть новые способности, а на пути к финалу стоят Мотаро и сам Шао Кан.